布鲁克代谢组学谱库

含有相关内源性和外源性代谢物的质谱库使您能够与实验MS/MS光谱相匹配，从而实现自动重复。这些光谱库中所含化合物的数量是一个重要因素，近年来不断增长，使识别越来越多的已知代谢物成为可能。

例如，新版本的力量MetaboBASE^®个人图书馆3.0。它包含:

• MS/MS谱来自于著名的METLIN(*)化合物库，包括二肽和三肽，以及内源性和外源性代谢物，超过10万个合成或分离标准物，用于研究生物系统中发生的变化。这些数据是在QTOF仪器上获得的。在Bruker QTOF仪器上获得了超过14,000个数据。
  
• 硅内生成的MS/MS谱为以上233000种化合物在这个库中，为更快地初步确定尚未作为纯参考标准可用的相关指标铺平了道路。
  

布鲁克元数据库^®个人图书馆3.0由著名的Gary Siuzdak教授和Paul Benton博士提供。

*METLIN™是THE Scripps Research Institute的商标。

注:Bruker MetaboBASE^®个人库3.0仅由MetaboScape^®4.0甚至更高。

不仅光谱的数量很重要，而且库中包含的数据的质量也很重要，这对于可靠的鉴定非常重要。
所有光谱都包含在布鲁克HMDB代谢物库2.0是手动检查去除噪声谱和污染峰。对前体离子和片段离子的质量进行了校正，使其与理论质量值和同位素模式分布相匹配。

这个光谱库的第二个版本提供了更多6000 MS / MS以上的光谱800种化合物从人类代谢组数据库(HMDB)和保留时间信息中选择。Bruker HMDB代谢物库2.0的数据采用纯参考标准。所有化合物都在碰撞系列QTOF高分辨率质谱仪上使用5种不同的碰撞能级进行测量。

保留时间信息对于大约600种代谢物的反相LC，添加了进一步的正交信息，以增加在例如尿液、血液和其他生物液体中发现的代谢物的鉴定的可信度。

的T-ReX洗脱代谢组学试剂盒:RP是专门的R埃弗斯-Phase LC柱试剂盒，使保留时间匹配到Bruker HMDB代谢库2.0中的相应值。它还包含LC-MS/MS数据采集的方法和标准操作程序(SOPs)，是完整的一部分

霸王龙LC-QTOF简化非靶向代谢组学的解决方案。

Bruker HMDB代谢物库由Bruker独家提供，由加拿大阿尔伯塔大学的Li Liang教授和David Wishart教授及其团队合作生成。

使用商业标准创建光谱，并假定在模型豆科植物Medicago truncatula中发现的代谢物。这使得植物和食品研究中的代谢物鉴定成为可能。Bruker Sumner MetaboBASE^®植物库还包含84个化合物的228个光谱，经MS和NMR鉴定。

最近在Bruker timsTOF仪器上获得的超过150种化合物的碰撞截面(CCS)值可以匹配来自捕获离子迁移分离的正交信息。这允许基于CCS值以及前驱体质量和同位素模式、保留时间和MS/MS谱来识别化合物。谱库包含在ESI负离子模式下获得的多碰撞能量谱。大多数化合物的分子式、结构为*。雷竞技怎么下载提供了mol格式、InChI格式和SMILES格式。

的Bruker NIST 2020质谱库是美国国家标准与技术研究所(NIST)的产品，由Bruker重新发布。该库包含完整的NIST包，涵盖Marbofloxacin抗生素，萘E&L, APCI，木木素葡萄糖苷黄酮，视黄酸代谢物，Fuc-GM1(d18:1/16:0)糖脂等化合物。它被细分为几个光谱库:

• NIST/EPA/NIH质谱库:该版本包含350,704个电子电离(EI)光谱(306,643个化合物，43,774个重复光谱)-比NIST17增加了39,729个化合物
• 气相色谱保留指数和方法库:包含139382个化合物的447,289个保留指数(RI)值，增加了40K个化合物。另有114,629种化合物同时具有RI和MS
• 小分子的NIST串联质谱库:包含来自30999个化合物的185608个前体离子的1,320,389个光谱

代谢组由小分子的复杂混合物组成，覆盖广泛的动态范围。随着可检测物质的数量不断增长，包括哺乳动物、微生物和植物的内源性和外源性代谢物，鉴定对于充分了解代谢组学数据的生物学背景至关重要。

因此，先前描述的已知目标代谢物的注释(称为重复复制)变得至关重要，必须是自动的和结论性的。
只有在化合物被高度确定的情况下，才能在生物学背景下获得有意义的见解。这种置信度是通过匹配存储在包含相关内源性和外源性代谢物的数据库和谱库中的不同标准来获得的。

从布鲁克上获得的高质量LC-MS/MS数据中获得的信息QTOF仪器并与光谱库相匹配，以确定准确的前驱体质量和同位素模式、MS/MS光谱和保留时间信息以及CCS值。MetaboScape^®允许根据用户定义的阈值级别匹配此信息。图形化的注释质量“AQ”表示使分析人员能够很容易地评估他们对MetaboScape中自动生成的每个注释的信心^®．

完全集成的MetaboScape支持几个互补的光谱库^®自动化和积极识别已知化合物的工作流程解决方案。这些代谢物库包括Bruker HMDB代谢物库、Bruker MetaboBASE^®个人库，Bruker MetaboBASE^®植物库，Bruker NIST光谱库，以及更多的公共和自定义库。

这些光谱库存储在您的PC上，提供本地搜索功能，以提供性能和整体，并消除隐私问题。

为了鉴定代谢物，需要收集所有可用的信息。这包括从纯标准的片段光谱与从代谢组学样品获得的光谱的比较。特定片段质量和强度分布对代谢物鉴定有重要价值。

属性查询谱库内容MetaboScape^®软件或力量DataAnalysis(除非另有说明)。两者都在本地pc上运行，并提供私人搜索功能。此外，这两种软件解决方案都旨在创建自定义库专利化合物，并将它们导出为ASCII格式。这允许共享库以开源的形式和同事交流。

使用Bruker库编辑器可以很容易地构建自己的MS/MS谱库。扩展现有化合物光谱的覆盖范围，或补充现有信息与进一步的参考测量，例如变化的碰撞能量。在多个碰撞能量下测量的库光谱确保了对广泛的代谢物的自动和高可信度的识别。