MetaboScape^®

MetaboScape^®使用统一的工作流程来处理来自Bruker的ESI & MALDI成像仪器的非靶向分析，简化了步骤数量，并快速定位和识别生物标志物。

MetaboScape^®可以跨应用领域使用，包括发现代谢组学、脂质组学、表型组学、食品组学、环境和制药，并为用户提供从基本ID到高级统计的灵活支持工作流。

• MetaboScape^®的强大T-ReX算法包括保留时间比对、脱同位素和特征提取，以确保稳健的数据处理
• 目标化合物可以使用用户定义的分析物列表自动注释
• 未知ID管道包括库匹配和在网上碎片化以方便未知ID
• 使用监督统计和非监督统计在复杂数据集中可视化相关信息，包括PCA, t检验，ANOVA, PLS和桶相关分析
• 标注质量(AQ)评分，提供数据质量的五个指标
• 路径映射在生物学背景下设置已识别的代谢物，从而将数据转化为知识
• 利用局部代谢物预测鉴定药物和异种生物代谢物
• 批量校正以抵消大样本队列中的样本效应
• 时间序列图用于研究代谢物随时间的变化
• 专用脂质组注释工具，包括基于规则的注释，4D Kendrick质量缺陷图和ccpredict
• 为了简化已知的识别，MetaboScape^®支持MetaboBASE个人库，HMDB代谢物库，Bruker Sumner MetaboBASE植物库(包括>130个化合物的CCS值)，以及定制库
• 自定义数据导出为适合导入的文件格式国民生产总值(全球天然产物社会分子网络)雷竞技怎么下载
• 客户-服务器架构支持快速数据处理和多个用户共享方法和访问共享数据集
• MetaboScape中的半目标工作流^®与目标工作流一起使用绝对量化TASQ^®

非目标分析的目的是识别具有特定生理状态或样本特征的特征。由于没有单一的工作流程来访问所有化合物的动态时间和空间指纹，因此需要评估来自互补平台的数据。MetaboScape^®通过对ESI和MALDI成像的补充数据进行评估，以及在其生物学背景下自信地分配相关标记，来满足这些需求。

通过集成工具支持未知化合物的识别，例如基于前体和片段精确质量的分子式确定(SmartFormula3D)，搜索本地和公共数据库(CompoundCrawler)，雷竞技怎么下载在网上碎片化以匹配理论与测量的MS/MS (MetFrag)和MS/MS桶匹配，用于识别化学相关化合物。

未知ID管道:
A) SmartFormula3D通过自动匹配精确的质量和同位素模式片段和前体离子信息，雷竞技怎么下载将可能的前体分子式限制为典型的一个或几个候选分子式。
B)在本地和公共数据库中查询候选公式，返回可能的结构候选。
C)在网上使用已实现的MetFrag功能将理论片段结构与测量的MS/MS峰值相匹配，并对最可能的结构进行评分。
D)可选的MS/MS桶匹配能够分配具有相似MS/MS光谱的化合物，以识别更多可能未知但可能结构相似的化合物。

药物代谢物的鉴定不仅对药物研究有很大的兴趣，而且对代谢组学、表型组学、暴露组学和非靶点筛选工作流程也越来越感兴趣。在这里，预计会出现药物或其他异种生物的代谢物，如农药、有毒物质或麻醉剂，这些代谢物可能属于未知的所谓暗代谢组化合物家族。

MetaboScape^®支持本地BioTransformer¹利用SpatialOMx工作流程，从液体样品和直接从组织中分配这些代谢产物的基于代谢物预测。此外，这些代谢物的时间变化可以通过使用集成时间序列图来跟踪和半量化。

^{([1] djoumbu - feunang等;化学信息学报2019,11:2)。}

MetaboScape中基于规则的注释例程^®能够识别脂质物种，同时考虑脂质组学标准倡议(LSI)指南。这种脂类(LC)注释工具避免了这种过度注释的风险，简化了脂类特征的自动识别。

MetaboScape^®可以计算和可视化肯德里克质量缺陷，转弯复杂质谱信息成一个的地图与点的信息聚类基于脂质特异性同源重复单位(如CH₂）．可定制的4D Kendrick质量缺陷图允许直观的脂质ID验证。提取的特征的各种特征可以在4个维度(x轴，y轴，颜色刻度和气泡大小)中绘制，允许多种应用。

• 策划保留时间vs m/z揭示了分离不同的脂类使用不同的颜色为不同的脂类．使用这种颜色编码，您可以很容易地发现相对于其他相同脂类在保留时间或CCS方面有明显偏差的注释。
• 策划m/z vs CCS，您可以通过观察到链长和双键数不同的脂类的CCS趋势来进一步询问脂类数据。这些趋势可以用来确认脂类id协助在未知数的标注并帮助消除误报．
  
• 用CH可视化Kendrick质量缺陷₂指定为重复单元允许快速调查所选类的脂类饱和度和链长一致性。此外，所示的标注为三酰甘油(tg)的脂类示例显示了使用反相色谱的预期洗脱顺序，以及充分利用所有4个互补维度的CCS值的增加趋势。
  

代谢组学和脂质组学分析的一个主要要求是快速查明和识别那些因摄动或疾病而变化的化合物。匹配保留时间、前体质量、同位素模式和MS/MS谱是获取化合物注释置信度的常用标准。PASEF^®timsTOF Pro上的数据采集每秒可提供数百个MS/MS事件，从而在单个分析中更深入地覆盖片段。雷竞技贴吧此外,PASEF^®光谱受益于离子迁移率分离，因此使用动态迁移率过滤器获得更清洁的MS/MS光谱。每个MS值与碰撞截面(CCS)值相补充，以测量分析物的形状，为ID提供进一步的置信度。

连同SCiLS™实验室软件，T-ReX²授权基于spatialomx的非目标分析处理和注释特征，包括药物代谢物，脂质和聚糖。map首次使用这种独特的T-ReX³组合进行空间分析，并将其与支持ccs的化合物注释结合起来，以实现在timsTOF fleX系统上使用MALDI成像获得的化合物的更高置信度注释。

色谱自由MRMS aXelerate工作流在表型组学研究中，通过省略耗时的色谱，提供更高的样品吞吐量。LC-MS分析不易检测到的化合物可获得，允许使用靶向和非靶向代谢组学方法。MetaboScape®中T-ReX 2D的数据提取为FIA MRMS数据的自动注释提供了信心。新型scimaX MRMS系统具有> 100万的质量分辨率和<0.2 ppm的质量精度。超高的分辨率使您能够利用同位素精细结构来明确确定元素组成。这为非靶向代谢组学中的化合物ID增加了另一层信心。