直接结果!
实时搜索结果=效率
打破瓶颈分析的数据集成实时数据库搜索和智能采集不提供的
普遍可用的
大规模并行处理与GPU的力量
不是数据回顾
TIMScore提供了最大数量的PSM,肽和蛋白质识别真4 d-proteomics通过使CCS维度。
不是搜索算法运行正常,结合CCS预测和测量值的比较和计算前5的TIMScore肽为每个光谱候选人。
TIMScore好处是意识到在peptide-validation和错误发现率(罗斯福)估计的步骤。在非CCS-enabled算法,只能利用二维估计罗斯福速率,因此区分线适合1%的误差(面板)区分正向和反向肽的候选人。TIMScore,和额外的CCS维度,peptide-candidates可以在三维矢量化(面板B)允许歧视波状外形的飞机用于实现相同的1%的误差。
应用歧视飞机提供更高的准确度和精密度,帮助验证标准两个维度得分psm以前不佳。
不是2023能够处理dia-PASEF工作流使用一个定制版本的流行DIA-NN由神经网络(DIA)软件从Lilley Rasler和Demichev实验室。蒂姆斯DIA-NN使可靠的、健壮的、定量准确的大规模的实验。不是利用相同的流dia-PASEF工作流机制,实时流媒体和女士DIA帧从收购电脑不是盒子。这些dia-PASEF数据处理和存储的不是盒子。结束的时候触发采集光谱库搜索,结果记录下来。TIMScore动力DDA搜索结果可以很容易地利用建立光谱库或光谱库可以从其他受欢迎的进口工具。在项目结束的用户可以触发match-between-runs分析查看项目之间的定量资料。这将提供给用户一个集成环境PASEF和dia-PASEF数据分析。
“我们正在进行的合作与力量裁缝DIA-NN流线型
dia-PASEF数据处理工具CCS重点都是真的
奖励。它简化和加速识别和量化
成千上万的蛋白质甚至很短的梯度。我们很高兴
在我们的密切合作与力量,vendor-integrated版本
DIA-NN叫做蒂姆DIA-NN现在变成不是生物信息学的一部分
平台。”
燃烧的搜索速度和搜索结果毋庸置疑。
)蛋白质ID复制银两的人类细胞溶解产物使用不是实时运行结果和以MaxQuant为基准
B)肽ID复制DDA运行的人类细胞溶解产物使用不是实时结果和以MaxQuant为基准
C)不相同和MaxQuant识别97%的蛋白质和90%相同的多肽。
不是从实时搜索提供了一致的结果,与离线搜索相同的数据。从数据库搜索算法在GPU上运行,搜索时间基于CPU的搜索相比可以忽略不计。
除了实时搜索的机会更大空间搜索特定的应用程序,包括包括peptidome研究,变成现实。不是以金本位为基准您搜索执行一样好或更好。
利用实时识别大大减少所需的时间dda-PASEFlabel-free定量(LFQ) match-between-runs (MBR)。
容易识别不良样品,重新获得他们运行&在开始前不定量的部分工作流程。基于我们的IM过滤XIC定量工作流是由人口普查算法(https://doi.org/10.1002/0471250953.bi1312s29)。
项目 | #的样品 | 女士收购长度(分钟) | 收购总时间(分钟) | LFQ处理时间(分钟) | 比例与收购 |
---|---|---|---|---|---|
测试 | 2 | 13.33 | 26.66 | 1.25 | 1/21 |
密集的他的数据 | 6 | 40 | 240年 | 26.2 | 1/9 |
Tenzer风格HYE124 | 6 | 120年 | 720年 | 24.5 | 1/30 |
人类Ecoli飙升 | 18 | 40 | 720年 | 116.8 | 1/6 |
惠稀释 | 4 | 120年 | 480年 | 13.1 | 1/37 |
等离子体应用笔记 | 212年 | 14.4 | 3052.8 | 59.6 | 1/50 |
蒂姆斯即4 d蛋白质组学数据视图提供了强大的能力就像从未见过。的流动分离和聚焦上游quadrapole和TOF导致的分离等压和等压附近的物种。使用其他技术和多功能天车的充实和复杂样品的分析是很常见的,co-eluting物种等压或质量上的等压co-fragment附近。timsTOF Pro / flex消除这首先分离离子的碰撞截面。想象的能力,搜索和排序等事件之前从来没有可用的。雷竞技贴吧我们与不同的流动值移动抵消术语等压质量质量一致(MOMA)和蒂姆斯即可以梳理此类事件在复杂的运行。雷竞技贴吧蒂姆斯即允许你设置你的自由裁量权,同时覆盖特性的公差和psm观察数据库搜索。蒂姆斯即可以查看之前你永远不知道有什么。
“实时的结果交付的盒子不是我们timsTOF Pro已经节约了大量时间。这让我们开发方法在实时通知信用证和仪器性能和整体效率的主要获得。”
“创新的软件工具是一个需要与质谱分析解决悬而未决的生物学问题。困离子迁移功能和鲁棒性的timsTOF Pro提供了独特的自底向上的蛋白质组学功能,可以有效地用于研究许多疾病。”
仅供研究使用。不用于临床诊断程序。