运行并处理BrukerProteoScapeTM

布鲁克proteoscapeTM

Bruker ProteoScapeTM平台GPU提供自下而上蛋白学并行计算能力并实时数据库搜索结果

即时结果

实时结果=效率

Bruker ProteoScapeTM高效省钱

实时结果通知你当前工具与样本状态

分析时间
数据库搜索需要时间,一完成获取后立即消除无故障搜索结果的这一步
乐器时间
确定分钟计数 与Bruker ProteoScapeTM
稀有样本
保存那些珍贵样本无论是单细胞、临床、SILAC或丰富PTMsBruker ProteoScapeTM智能确认不浪费
费用计算
乐器时间、试剂和样本准备耗资巨大 。 Bruker ProteoScapeTM和RunDone会省钱,因为你确信你正在产生有意义的数据

4D-ProteomicsTM实时搜索结果和智能获取

整合Bruker ProteoScapeTM提供的实时数据库搜索和智能获取,破解数据分析瓶颈

普遍可用

4D-ProteomicsTM

  • CCS驱动数据丰富,即使是实时数据库搜索能力也是现实,Bruker ProteoScapeTM

大规模并行GPU电源

  • Bruker ProteoScapeTMGPU提供大规模计算电源遍及千千CUDA核心

Bruker ProteoScapeTM数据评审

  • 查看数据复杂细节从高水平实验信息到特定分离层频谱,并满怀信心地从布吕克普罗特欧ScapeTM机内综合查看器

智能学

  • Bruker ProteoScapeTM智能化用户定义的蛋白质或粒子获取结束决定样本队列的进程,检验适配性,保存贵重样本,昂贵消耗品和工具时间


时间节约和成本节约

  • 不再担心注射那些珍贵样本
  • 不再担心浪费工具时间
  • 不再担心那些样本 昂贵试剂和样本准备 只注入性能差系统
  • 不再等待QC运行判定系统适配性
  • 方法开发期间不再等待查找结果

创新软件工具用质谱处理未解生物问题受困离子运动功能和强健timsTOFPro提供自下而上独有蛋白学能力,可有效用于研究多项疾病。”

John Yates三世教授Hahn教授加利福尼亚州La Jolla脚本研究所

TIMSCORTM-机器学习CCS开发改善FDR

TIMScoreTM提供最大数PSM、eptide和蛋白识别4D工程学.

Bruker ProteoScapeTM搜索算法同常操作,加之预测测量CCS值比较并计算5级顶端Pepti

TIMScoreTM效益实现过程为Peptide验证和假发现率估计步骤非CCS辅助算法中,只有两个维度可用于估计FDR率,因此偏差线适合1%误差(A分组)分辨前向和逆向偏差TIMScoreTM和额外的CCS维度可分三维向量化(B分组),允许应用偏差轮廓平面实现相同的1%误差

应用偏差平面提高精度和精度,帮助验证标准二维前评分差



PSEF速度异步

深入发现免疫机能学、元蛋组学以及其他需要免置排序应用,我们与快速Novor公司开发BPSNVORimsTOF数据提供最快速、最精准重排序结果,并有Run&Done所有长处

广度评分模型培训并优化TimsTOF平台大于1,780,000光谱,包括各种非磁共振sTOF平台平均处理>1000光谱/二分数并出借实时自转顺序BPSNVOR持续优于标准NVOR和软件A

BPS Novor不显示明显的消化特征或物种偏差,比竞技产品快20倍

PASEF技术搭配timsTOF平台、Bruker ProteoScapeTM和BPS Novor为包括免疫机能学在内的各种应用实时异步提高敏感度

高超搜索多年来一直是我实验室研究中关键方面, 算法能力能以获取速度精确交付结果, 我们可以大规模实时评估免疫机能样本并推送工作流更接近于向前所未有时间尺度提供这些分析的临床影响。”

Anthony W.教授Purcell,澳大利亚墨尔本Monash大学Immnoproteomics实验室主管

i-PASEF®BrukerProteoScapeTM工作流简化与TIMSDIA-NN

BrukerProteoScapeTM处理Dia-PASEF®工作流使用Lilley、Rasler和Demichev实验室广受欢迎的DIA-NN软件TIMSDIA-NN启动可靠、强健和量化精确大规模实验Bruker ProteoScapeTM使用同流机制®工作流程流转实时MSDI框架从获取PC转BrukerProteoScapeTM框Dia-PASEF®数据处理并存储在Bruker ProteoScapeTM框中获取结束时启动光谱库搜索并记录结果TIMScoreTM驱动DD检索结果很容易用于建设光谱库或光谱库从其他常用工具导入项目尾端用户可触发匹配运行分析以查看跨项目量化剖面向用户提供PASEF综合环境®dia-PASEF®数据分析

Y轴计数和X轴共K562pit梯度长度为35分钟,支持每日30个样本并用timsTOFPro2进行所有实验

与Bruker持续协作 定制DIA-NNdia-PASEF数据处理工具以CCS为焦点实为有益简化并加速识别并量化千分之千分之极短梯度令我们高兴的是,在我们与Bruker的密切合作中,供应商综合版DIA-NN即TIMSDIA-NN现在成为BrukerProteoScape生物信息学平台上

师傅博士markus Ralser,爱因斯坦生物化学教授

完全数据库搜索小5ms

闪亮搜索速度不折不扣搜索结果

a) 原创ID复制DD运行人体解析使用Bruker ProteoScapeTM

spectideID复制DD运行人体解析使用Bruker ProteoScapeTM

Bruker ProteoScapeTM和maxQuant识别97%同质物和近90%同质物

Bruker ProteoScapeTM提供实时搜索一致结果,与离线搜索相同自数据库搜索算法运行GPU后,搜索时间可忽略不计与基于CPU搜索

除实时搜索外,搜索大空间包括peptidome研究也成为现实。 Bruker ProteoScapeTM测试DD搜索金本位或优或优

hOSSLFQ工作流实时辅助ID

利用实时识别大幅减少所需时间da-PASEF免标签量化匹配MBR

  • TIMscoreTM使用CCS增强标识
  • 典型, 1/ 20获取时间执行量化
  • 批量时间使用BrukerProteoScapeTM

容易识别不良样本并重新获取并完成BrukerProteoScapeTMIM过滤XIC量化工作流由Census算法驱动https://doi.org/10.1002/0471250953.bi1312s29)

实时结果由Bruker ProteoScape框传送允许我们开发实时方法, 通知LC和工具性能 并整体提高效率

Sebastian Vaca博士研究科学家,MIT广学和哈佛大学Proteomics平台