代谢组学方法

几个关键步骤是重要的自信确定化合物相关的动态代谢过程;包括样品制备、数据采集和数据评估。有意义的见解在生物环境中只能获得如果这些工作流步骤控制。为了简化和协调这些力量,与梁李教授和他的团队合作在阿尔伯塔大学,加拿大,开发了霸王龙^®LC-QTOF解决方案。

关键的第一步一道代谢组学是一个可复制的样品制备。因此,标准操作规程(sop)准备典型临床研究样本,包括尿液和血浆,作为代谢组学的一部分提供的解决方案。

收购高质量质/ MS数据遵循样品制备在一道代谢组学工作流,霸王龙^®LC-QTOF解决方案,不需要质/ MS参数优化。分析大样本人群需要高稳定保留时间洗提UHPLC结合专用的霸王龙^®洗提Metabolomics-kit: RP。反相LC列工具包允许保留时间的匹配值图书馆2.0力量HMDB代谢物。的影响二世MS / MS数据采集使用优化参数及其强劲的性能是高质量数据采集的基础,使广泛的复杂样品的分析研究。

数据采集后,MetaboScape^®软件提供的数据评估,使自动和自信相关已知化合物的识别:

• 独特的霸王龙^®3 d特征提取技术是后续的关键代谢物鉴定和统计数据评估。通过自动进行参数自由保留时间校准和地区完整的提取,提取所有相关信息,使自信代谢物鉴定,同时减少假阴性率统计分析。

• 的图书馆2.0力量HMDB代谢物作为代谢组学的一部分解决方案提供了MS / MS谱与保留时间信息> 600 > 800种代谢物相关的代谢物。图书馆是一个自信的相关标记的识别的先决条件。

• In-silico MS / MS谱产生的力量MetaboBASE^®私人图书馆3.0使初步识别相关的目标尚未公布作为纯粹的参考标准。

• 注释质量得分(AQ)提供了一个快速概述在每个注释参数给予信心。

• 路径映射功能使设置确定化合物的生物环境。

表现型由磁共振质谱(mrm)

深代谢分析复杂混合物的发现启用了代谢组学在表现型UHPLC-QTOF-MS / MS分析。通常不同的LC方法和数据采集在积极和消极离子模式相结合是有代价的;所需的时间为每个样本分析。
磁共振质谱(mrm)极端决议使加速度phenomics和发现样品处理量的代谢组学研究省略耗时的色谱法。流动注射分析(FIA)或基于谱技术的工作流提供化合物不易被质分析,同时分析已知和未知代谢物。
高通量的需要,通常遇到phenomics研究UHPLC-QTOF-MS / MS分析辅以mrm aXelerate,一个LC-free mrm工作流解决方案,检测并生成分子公式> 1000中每个样本的代谢物和揭示了许多额外的代谢物水平未见的质包括极性化合物。雷竞技怎么下载mrm FIA的分析或MALDI样本提供高吞吐量的表型出现复杂的样品(如尿液和血浆中提取)。强大的数据提取了霸王龙^®二维的MetaboScape^®在自动注释提供了信心。这是通过质量< 0.2 ppm的准确性和质量分辨率可以超过> 100万,从而提高同位素精细结构忠诚。

学习在这个最近出版FIA-CASI-MRMS工作流如何帮助解决寻求照亮了“黑暗物质代谢”通过增加2.6倍与人类代谢组匹配数据库和增加IFS模式:一个增强的同位素精细结构的质量分析方法发现代谢组学:FIA-CASI-FTMS