timsTOF HT
高通量4 d-proteomics™
高动态范围和定量精度
做marquants
扩大高通量的功能4 d-proteomics™
的特性
蒂姆斯基于离子流动分离和CCS-enabled分析
新的timsTOF HT质谱仪是配备了第四代高容量TIMS-XR分析仪和先进数字化仪技术(ADT)。它提供了更高的动态范围的无与伦比的深度分析和定量高通量蛋白质组学实验。timsTOF HT完全PASEF CCS-enabled和支持®收购模式包括PASEF®,dia-PASEF®和prm-PASEF®实现灵活性4 d-proteomics™。简单的不妥协大规模蛋白质组深度。
应用程序
与dia-PASEF启用快速组织蛋白质组分析®
快速心脏组织蛋白质组学。分析了不同数量的小鼠心脏蛋白质组消化与短液相色谱梯度和dia-PASEF一式三份®。在最高负荷样本,我们发现在4700年总蛋白质组横跨超过5数量级的相对丰度。原始数据处理与DIA-NN library-free模式和蛋白质副本的人数估计与“蛋白质组学统治者”的方法。
“组织分析是临床蛋白质组学的一个重要领域,然而极具挑战性和活检组织部分组成一个大大异构的细胞群。的dia-PASEF®收购方式在timsTOF HT仪器量化蛋白质在大动态范围甚至是出了名的困难样本如心脏组织在不牺牲吞吐量或敏感性”。
前所未有的深度与dia-PASEF细胞系®蒂姆斯DIA-NN和不是
更高的蛋白质组的深度,增加蛋白质消化负荷提高识别。人类细胞系K562的胰蛋白酶的消化(Promega)分析了使用nanoElute分离系统在250 nL /分钟60分钟时间在一个极光列(25厘米,75μm ID, IonOpticks)。在dia-PASEF timsTOF HT操作®使用100 ms蒂姆斯分离模式。使用预测数据处理商旅DIA-NN图书馆从uniprot(人工审核)。
有针对性的血浆蛋白质组学:量化30分钟梯度超过550种蛋白质
我们结合使用PQ500 (Biognosys)稳定同位素标准dia-PASEF (SIS)®基于趋近于使用30分钟timsTOF HT梯度。578蛋白质(对应804肽)可以准确量化> 99%的数据完整性。这种方法结合了传统的SMS / MRM方法的选择性和灵敏度的易于使用的采集设置,还允许定义新的目标后验。
纳米LC列高等示例加载,等待最好的结果
一)TIMS-XR允许增加离子的示例加载能力超出200 ng。可再生的识别~ 6900蛋白质组和86000多个独特的肽。
B)数量的标识使用不即时搜索引擎TIMScore™对于dda-PASEF 1600 ng K562胰蛋白酶的消化。误差线表明标准差5复制意味着显示直方图之上。
使用一系列PepSep 25列(150μm ID, 1.5μm粒度),平均峰值的宽度小于5秒了K562胰蛋白酶的消化(Promega)示例加载1600 ng。梯度41分钟的时间是足够有效肽分离,导致同质肽洗脱梯度即使在高肽负载。
Temoignages
“我们正在进行的合作与力量裁缝DIA-NN dia-PASEF流线型的处理工具®数据与一个CCS重点都是有益的。它简化和加速识别和量化成千上万的蛋白质很短的梯度。我们很高兴在我们的密切合作与力量,vendor-integrated版DIA-NN叫做蒂姆DIA-NN现在变得不是生物信息学平台的一部分。”
Consommables
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仅供研究使用。不用于临床诊断程序。