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交叉质谱即时可使用phox交叉联系器和TIMS/PASEF方法

BILLERICA质量布鲁克公司今日宣布与乌得勒支大学协作推进三维结构研究以及通过质谱法对蛋白交互乌得勒支大学艾伯特赫克实验室20多年来一直是蛋白质组学和通过质谱学研究蛋白结构与交互作用的领先者。Richard Scheltema最近加入Utrecht大学,作为集团首选,关注结构学和交互质谱学交叉联动

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协作工作将侧重于开发TIMS方法(TrappedIon移动分光度测量)和PASEF方法(Paralle累积串行分解法),并开发交叉链路器和XL-MS软件timstoFPro4D-Proteomics质谱计,以便利用它独特的大规模精确CCS工作流程基础论文中已经描述过这些 " 。串通跨段辅助预选(Caps-PASEF)对交叉质谱学的益处雷竞技怎么下载刚发表在分子和细胞质组学突破论文^一号

Bruker计划将协作结果商业化,作为使用XL-MS研究蛋白质结构与交互作用的综合解决方案组合小说丰富PhoX交叉路由²由Heck和Scheltema开发 极速敏感PASEF系统方法上timstoFPro平台帮助发现更多交叉产品,产生更多蛋白质结构与交互信息高级分析软件是关键,因为XL-MS数据比典型射枪蛋白学实验复杂甚至信息丰富Scheltema正努力增强创新XlinkX软件处理TIMS/PASEF数据并提供给社区timstoFPro用户.

乌得勒支大学的Albert Heck表示:「我们很高兴与Bruker合作开发XL-MS工作流程,利用PASEF速度和独特的大规模精确CCS数据提高XL-MS交叉连接检测雷竞技怎么下载令我们兴奋的是分子和细胞质子学上发布的初步结果,并期望进一步推进XL-MS离子运动分离和CCS应用timstoFProglycoproteomics和自上而下protemics

博士布鲁克Proteomics副总裁Gary Kruppa表示:“2001年Sandia国家实验室曾亲自参与XL-MS概念性工作,我相信Heck集团的进展将使这项技术更常用使用结构生物学研究timstoFPro.与乌得勒支大学协作,

Edrecht大学的Richard Scheltema表示:「我集团打算推开PASEF边界,生物信息学方面正在做出重大努力,应用xlinkX软件分析xl-MS数据^3,4与开放数据格式架构合作令我们兴奋timstoFProXlinkX开发代码可用大规模精确CCS值识别交叉链路并进一步提高假发现率计算

1. 串通跨段辅助前台选择(Caps-PASEF)对交叉质谱学的好处Steigenberger B,van denTorn H,BijlE,GreischJF,RatherO,LubeckM,PietersRJ,Heck AJR,ScheltemaRAMol细胞分解2020 Jul 21:mcp.RA120.002094doi:101074/mcp.RA120.002094在线前打印
2. PhoX:IMAC增富跨链路试剂Steigenberger B公司、PietersRJ公司、HeckAJR公司、ScheltemaRA公司ACS中位 sci2019Sep255(9)15141522
3. 蛋白质组件剖面交叉质谱刘F,RijkersDT,PostHNat方法2015 Dec121179-84doi:10.1038/nmeth3603
4. Klykov O.Steigenberger B.Pektaasset al.高效稳健的子系统交叉质谱法Nat Protoc 2018 12月13日 2964-2990https://doi.org/10.1038/s41596-018-0074-x

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乌得勒支大学Heck-lab和Scheltema-lab

Albert Heck和Richard Scheltema研究组嵌入乌得勒支大学理学院集团主要侧重于开发和应用高级质谱学蛋白学技术补充蛋白质组学工作,该组也以其在质谱基础结构生物学、原生质谱学和交叉质谱学的先导方法方面的专门知识而闻名团队协调欧洲蛋白质组研究基础系统(EPIC-XS链路Scost-xs.eu)并领导荷兰X-Omics倡议中的蛋白质组核心www.x-omics.n)

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