- PaSER™Novor免疫肽组学更快、实时从头测序
- 使用PaSER 2023b蛋白质组学软件进行无库dia-PASEF®分析
- 与Mass Dynamics合作进行4D-Proteomics™知识可视化
芝加哥——(业务线)在第19届美国HUPO上，力量公司(纳斯达克股票代码:BRKR)宣布在timsTOF平台上推出4d -蛋白质组学的重要生物信息学产品:一种新颖的产品新创测序算法是与Rapid Novor公司合作开发的，使用超过170万个PASEF数据点来实时提高免疫肽组学的准确性和速度。无与伦比的灵敏度timsTOF SCP系统与新的PaSER Novor算法相结合，为免疫肽组学，特别是小肿瘤活检样本提供了显着的性能提升。
timsTOF SCP超高灵敏度质谱(图片来源:美国商业资讯)
使用无库TIMS DIA-NN软件进行dia-PASEF数据分析，现在具有进一步提高的量化精度，而Mass Dynamics图形可视化和统计云软件现在与4D-Proteomics dia-PASEF数据无缝集成。
A. PaSER Novor用于免疫肽测序
与不是Novor年，布鲁克推出了先进的免疫肽组学功能，与Rapid Novor公司该公司是加拿大抗体测序软件和CRO服务公司。
免疫肽组学需要在timsTOF SCP超高灵敏度平台上对小肿瘤活检样本中非蛋白水解性质的肽进行测序。蛋白质组学数据库算法的搜索空间太大，无法进行精确搜索，从而导致重现性低、搜索时间长。不是Novor从片段离子谱中导出肽序列新创通过使用支持gpu的Bruker，使用超过170万timsTOF数据点进行实时结果训练不是蛋白质组学软件平台。
莫纳什大学免疫蛋白质组学实验室负责人Tony Purcell教授说:“新创多年来，搜索一直是我实验室研究的一个重要方面。这种新颖的算法以数据采集的速度提供准确的结果，并实现大规模和实时的免疫肽组学。这对我的团队将研究转化为可操作信息的速度有重大影响，并且它使该工作流程更接近于在前所未有的时间尺度上为临床患者提供影响。”
B. TIMS-DIA-NN 2.0启用Library-free dia-PASEF
TIMS DIA-NN是一个以ccs为中心的DIA-NN[1]版本，具有显著的增强。TIMS DIA-NN 2.0现在可以在无库的方法中处理dia-PASEF数据，通过新颖的机器学习功能进一步提高量化精度。
加州大学戴维斯分校蛋白质组学核心设施主任Brett Phinney博士评论说:“蛋白质组学已经取得了长足的进步，但色谱和数据分析与质谱仪器一样重要。在大样本队列上进行稳定的色谱分析，再加上对DDA和DIA的实时搜索，使我的实验室的效率达到了新的水平，而TIMS DIA- nn的无库搜索功能只会使这一点变得更好。”
C.基于质量动力学的4d蛋白质组学图形知识可视化
通过Bruker与WEHI的Andrew Webb教授的合作，timsTOF 4D-Proteomics现在可以利用Mass Dynamics的统计分析，交互式和直观的可视化来提取蛋白质组学的知识。Andrew Webb是澳大利亚软件公司Mass Dynamics Pty Ltd的联合创始人。除了蛋白质组列表之外，火山图、蛋白质-蛋白质相互作用、PCA图和无数其他可视化图有助于了解生物学和疾病。
Mass Dynamics的联合创始人兼首席执行官Paula Burton表示:“PaSER的实时搜索和Mass Dynamics的发现服务的整合是一个强大的联盟。生命科学家现在可以专注于生物学问题，并利用蛋白质组学来寻找答案。”
布鲁克生命科学质谱学信息学总监Dennis Trede博士评论道:“我们很高兴与快速Novor和质量动态都带来了有意义的蛋白质组学进展。超高的灵敏度timsTOF SCP与快速Novor现在可以从小肿瘤活检中进行大规模免疫肽组学。”
在美国HUPO上公布的所有布鲁克软件解决方案都可以与所有型号的timsTOF平台一起使用:timsTOF Pro 2, timsTOF HT, timsTOF SCP和timsTOF fleX。的BiognosysSpectronaut®17软件，其新颖的直接DIA+能力，在国际HUPO坎昆会议上推出，也完全支持DIA - pasef时间数据。
引用:
- [j] .自然科学学报。2022;13(1):3944。https://doi.org/10.1038/s41467-022-31492-0。
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资料来源:布鲁克公司