SCiLS™实验室

MALDI成像数据的分析和可视化从未像Bruker的软件那样容易。

强大的可视化和报告功能

• 即时和直观的可视化离子图像和质谱
• 灵活的呈现选项，用于可视化空间复合分布和分布模式
• 引人注目的统计图表和报告
• 三维MS成像研究的体积可视化(可选)
  

先进的数据处理和分析

• 先进的机器学习算法的数据集几乎无限的大小
• 鉴别光谱特征与相关光谱特征的比较分析
• 用于非目标聚类和数据挖掘的无监督空间分割和成分分析
• 用于在临床和临床前研究中描述区域的元数据注释
• 用于未标记样品分类的分类模型
• 基于稀释级数的分析物定量
  

工作流和可扩展性

• 针对各种针对性和非针对性SpatialOMx工作流程的综合工具
• 与数字病理学的组织学注释整合
• 广泛的应用程序编程接口(API)，用于自动报告和高级工作流集成
• 导出MS成像数据到开放的行业标准imzML
• 从imzML或各种第三方供应商的成像数据格式导入MS成像数据集(可选)

系统需求
建议系统要求如下:

• 英特尔酷睿i7处理器或英特尔至强处理器(或同等产品)，至少4核
• 微软Windows 10 64位操作系统
• 64 GB RAM(大型数据集推荐128 GB)
• 1tb磁盘空间(推荐SSD，详见下文)
• 全高清显示(1920 x 1080)或更大
• 图形适配器支持OpenGL 3.2，建议GPU内存至少4gb

为了获得最佳性能，应该使用固态驱动器(SSD)来承载SCiLS™Lab数据文件。

SCiLS™实验室集成了所有主要质谱供应商的数据，包括Bruker的FLEX系列而且mrm，以及以开放imzML格式提供的数据集。为timsTOF fleX离子迁移数据，SCiLS™实验室显示大规模迁移离子图像，允许ccs支持的数据解释。

多个样品的比较分析可以在2D和3D中可视化，使大量应用于药物开发，组织分辨生物标志物的发现和翻译病理学研究，以补充免疫组织化学。

SCiLS™实验室支持直接从组织中对目标分子进行MSI定量的直观工作流程。它集成了SpatialOMx工作流MetaboScape^®并将检测到的特征(代谢物、脂质、聚糖)的注释MALDI分子组织图像可视雷竞技怎么下载化。为了与组织学集成，SCiLS™实验室提供了一个强大的开源软件接口QuPath广泛应用于数字病理学。

临床研究中的大样本队列
在临床生物标志物研究中鉴别离子的发现，需要分析大样本队列和海量数据。SCiLS™Lab可以轻松地将样本元信息链接到MALDI MSI数据，节省时间并避免错误。来自数字病理学的组织学注释通过接口集成到强大且广泛使用的开源应用程序中QuPath．

自动阐明鉴别病理生理改变的光谱特征是很容易的。只需点击一下，SCiLS™实验室自动量化离子在不同生物状态之间的区分程度。由此产生的新型生物标志物候选列表可以很容易地导出用于后续分析。

发现强大的数据挖掘功能，现在只是一个单一的点击!

全身成像
可视化药物和代谢物分布在全身组织切片中，在样本处理、采集和计算数据分析方面仍然是一种具有挑战性的方法。

SCiLS™实验室为整个MALDI MSI数据分析工作流程提供工具。一个软件可以处理由数百万个光谱组成的多个数据集，从光谱预处理中多个单独数据集的配准到综合统计分析。