布鲁克代谢组学谱库

関連する内因性および外因性代謝物を含む質量スペクトルライブラリーを使用すると,測定したMS / MSスペクトルにマッチするスペクトルを自動解析することができます。スペクトルライブラリーに含まれる化合物の数は重要な要素であり,近年継続的に増加しており,既知代謝物の同定を可能にしています。

この点において，ブルカ，MetaboBASE®个人图书馆3.0の新バ，ジョンには下記の利点があります。

• 内因性および外因性代謝物,ジペプチドやトリペプチド,さらに有名なMETLIN(*)化合物ライブラリーから得られた10万以上の合成または単離された標準物質のMS / MSスペクトルは,生物学的システムで起こる変化を研究するために使用されます。これらのデータはQTOF装置で取得されており,14000件以上のデータがブルカーQTOF装置で取得されています。
• 233000以上の化合物のms / msスペクトルを在网上で生成したライブラリーは,純粋な標準物質が利用できないターゲットの暫定的な同定を迅速に行うための道を開きました。
  

すべてのスペクトルは,異なる衝突エネルギーでポジティブ,ネガティブの両モードで測定し,品質の悪いスペクトルは破棄されています。衝突エネルギ，は，在网上ライブラリーでは10、20、40 ev,その他のライブラリーでは10/25,25/50eVを用いました。スペクトルデータの補足として,InCHi,微笑,中科院の識別子とほとんどの物質の同義語が掲載されています。HMDB、METLIN PubChemなどの外部データベースへのデータベースIDとハイパーリンクにより,同定された代謝物の生物学的な位置づけを迅速に知ることができます。

Bruker MetaboBASE®个人图书馆3.0は，著名なGary Siuzdak教授とPaul Benton博士によって提供されています。

*METLIN™は斯克里普斯研究所の商標です。

注:Bruker MetaboBASE®个人图书馆3.0はMetaboScape®4.0以上でのみサポ，トされています。

布鲁克HMDB代谢物库2.0に含まれるすべてのスペクトルは，ノ手作業で取り除きました。プリカーサーイオンとフラグメントイオンの質量は,理論的な質量値と同位体パターン分布に一致するよう補正しました。

このスペクトルライブラリーの第2版では,人类代谢组数据基地(HMDB)から抽出された800種以上の化合物にいて，6000以上のms / msスペクトルと保持時間情報を提供しています。力量HMDB Metabolite Library 2.0のデータは、純粋な標準物質を使用して取得しました。すべての化合物は、5種類の衝突エネルギーを用いて、impactシリーズQTOF高分解能質量分析計で測定されています。

約600種類の代謝物の逆相lcにおける保持時間情報は、尿、血液,その他の生体液などで検出される代謝物の同定の信頼性を高めるために,さらに直交する情報を追加します。

T-ReX洗脱代谢组学试剂盒。RPは,力量HMDB代谢物图书馆2.0の保持時間と一致させるための逆相LCカラムキットです。また，lc-ms / msデ，タ取得のためのメソッドと標準操作手順書(sop)が含まれています。

霸王龙LC-QTOFソリュ，ションは，シンプルなノンタ，ゲットメタボロミクスのためのソリュ，ションです。

力量HMDB代谢物图书馆はカナダのアルバータ大学梁李教授とDavid Wishart教授,およびそのチームとの共同研究で作成されました。布鲁克が独占的に提供しています。

市販の標準物質を用いてスペクトルを作成し，モデルマメ科植物であるMedicago truncatulaに含まれる代謝物を同定しました。これにより，植物や食品研究における代謝物の同定が可能になります。また、Bruker Sumner MetaboBASE®植物库には，msとnmrによって同定された84化合物の228スペクトルが含まれています。

最近150種類以上の化合物について力量timsTOFで取得した衝突断面積(CCS)値が追加されたことにより,トラップド・イオンモビリティ分離から得られた直交情報によるマッチングが可能になりました。これにより,プリカーサー質量や同位体パターン,保持時間,MS / MSスペクトルに加えて,CCS値に基づいた化合物の同定が可能になりました。ほとんどの化合物について,分子式,* .mol形式の構造,InChI,および微笑が提供されています。

Bruker NIST 2020质谱库は，米国国立標準技術研究所(nist)の製品で，ブルカ，が再配布しています。このライブラリーは完全なNISTパッケージを含み,Marbofloxacin抗生物質,萘E&L, APCI,木樨草素黄酮甙、レチノイン酸代謝物,Fuc-GM1 (d18:1/16:0)糖脂質などの化合物をカバーしています。いくかのスペクトルラブラリに細分化されています。

• NIST / EPA / NIH质量光谱库:350704個の電子イオン化(EI)スペクトル(306643年化合物,43774年個の複製スペクトル)が含まれており,NIST17よりも化合物数が39729個多くなっています。
• ガスクロマトグラフィー保持指数およびメソッドライブラリー:139382年化合物の保持指数(RI)値が447289個収録されており,40000年化合物が増加しています。さらに，riとmsの両方を持114,629化合物が含まれています。
• 低分子のNISTタンデムマススペクトルライブラリー:30999種類の化合物から185608個のプリカーサーイオン,1320389スペクトルが含まれています。
  

メタボロムは，広いダナミックレンジにまたがる低分子の複雑な混合物で構成されています。検出可能な物質の数は,哺乳類,微生物,植物由来の内因性および外因性代謝物を含むように増加し続けており,メタボロームデータの生物学的背景を完全に理解するためには,同定が不可欠です。

そのため,以前に記載された既知の標的代謝物のアノテーションは,自動的かつ決定的なものでなければなりません。化合物が高い信頼性をもって同定された場合にのみ，生物学的に意味のある洞察を得ることができます。この信頼性は,関連する内因性および外因性代謝物を含むデータベースやスペクトルライブラリーに保存されているさまざまな基準に照合することで得られます。

力量qtof装置で取得した高品質の质/ MSデータとスペクトルライブラリーを照合することで,信頼性の高い同定が可能になります。MetaboScape®は，ユ，ザ，が定義可能なしきい値レベルに応じてこれらの情報をマッチングさせることができます。グラフィカルなアノテーション品質“AQ”表示により,分析者はMetaboScape®で自動的に生成された各アノテーションの信頼性を容易に評価することができます。

完全に統合されたMetaboScape®ワークフローソリューションでは,既知化合物の自動同定のために,いくつかの補完的なスペクトルライブラリーがサポートされています。これらの代謝物ライブラリーには,力量HMDB代谢物图书馆,力量MetaboBASE®的个人图书馆,力量MetaboBASE®植物库,力量NIST谱库,さらにパブリックライブラリーやカスタムライブラリーが含まれます。

これらのスペクトルライブラリーはPCに保存され,パフォーマンスとスループットの両方を提供し,情報管理に対する懸念を排除するためにローカル検索機能を提供します。

代謝物の同定には，利用可能なすべての情報を収集する必要があります。これには,純粋な標準物質のフラグメントスペクトルとメタボロミクスサンプルから得られたスペクトルの比較も含まれます。フラグメントの質量と強度分布は，代謝物の同定に非常に重要な役割を果たします。

スペクトルラブラリの内容は，MetaboScape®ソフトウェアまたはブルカDataAnalysisを使用して検索されます。どらもロカルPC上で動作し，プラベト検索機能を提供します。さらに，両方のソフトウェアソリュ，ションは，専有化合物のカスタムラ@ @ブラリを作成し，asciiフォマットにエクスポトするように設計されています。これにより，ラブラリをオ，プンソ，ス形式と共有することができます。

オリジナルのMS / MSスペクトルライブラリーは,ブルカーのライブラリーエディタで簡単に作成できます。既存の化合物スペクトルのカバレッジを拡張したり,様々なコリジョンエネルギーで測定したスペクトルを参照して既存の情報を補完したりすることができます。複数のコリジョンエネルギーで測定されたライブラリースペクトルは,幅広い代謝物の自動同定と高い信頼性を保証します。