代謝物リファレンスデータベース
BBIOREFCODE 2は、体液中の代謝物として、あるいは食品、飼料、飲料サンプル中の成分として検出された800種類の化合物のスペクトルが収載されたデータベースです。様々な代表的な不純物も含まれています。
AMIXソフトウェアは、データベースに含まれる化合物を混合物のスペクトルから同定するための強力な検索アルゴリズムを提供します。これにより、スクリーニングのアプリケーションでも、スペクトル中の予想していない信号を帰属し、成分の同定が可能になります。
異なるpH値のスペクトルが含まれているため、混合物のスペクトルとデータベースの実験条件を照合して、データベース検索が可能です。
NMRスペクトルは、きちんと調整された600MHz装置で測定されています。プロトンスペクトルは、pH3から8までの11の異なるpH条件で提供されます。主要なpH3、5および7については、2Dスペクトル(JRES、COSY、TOCSY、HSQCおよびHMBC)とpH3および7の13Cスペクトルが提供されます。全ての化合物には3D構造が登録されており、スペクトルの帰属も完全に行われています。データ生成は継続的に行われているため、一度インストールされたデータベースは、新しく利用可能となった化合物のパッケージを追加することでアップグレードや拡張が可能です。
2018年6月に、全pH値の50化合物の新しいパッケージ、BBIOREFCODE 2がリリースされました。これにより、合計で800化合物が利用できるデータベースとなりました。
高いデータ品質
データベースで提供される全てのスペクトルは、きちんと調整された600 MHzで水溶液を測定したものです。最大11種類のpHのデータが提供され、混合物のスペクトルの実験でも正確に一致させることができます。
全てのスペクトルはクリーンアップされ(履歴ファイルでレビュー可能で、全ての作業ステップはリスト化)、完全に帰属されています。データベースは、データ量を大幅に削減する特別な圧縮形式で保存されており、非常に高速な検索が可能なだけでなく、多数のスペクトルの同時処理が可能となっています。
データベースと利用方法
BBIOREFCODEの現在の完全版データベースには、800成分が含まれています。350の基本化合物パッケージ、150のメジャーアップグレードパッケージ、そして現在は50化合物ずつの5-6種類のマイナーアップグレードパッケージで構成されています。これらのパッケージは個別に購入することができ、いつでもパッケージ単位の追加アップグレードが可能です。
パッケージデータベースを使用するためには、他にAMIXが必要で、既存のAMIXを使用することもできます。
利用可能なパッケージ
BBIOREFCODE2 pH7スペクトルは、体液用途の場合にのみpH7で行われます。現在、700の化合物を持つ完全なデータベース。
最新版
既存のBBIOREFCODE2には、化合物751~800用のアップグレードパッケージ6が、SHD011(A)-06として提供されています。
含まれるデータ
通常、データはpH3からpH8まで、pH0.5刻みで11の異なるpHで提供されます。2Dデータは、COSY、TOCSY、JRES、HSQCおよびHMBCを含むpH3、5および7です。一部の化合物については溶解性や安定性が理由で、あるpH範囲や、2Dおよび13Cデータ測定が困難なことがあります。
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