鸟枪蛋白鉴定

复杂性问题
在一个典型的散弹枪蛋白质组学实验中，来自超过一百万个蛋白质形态的肽，覆盖了高达10个数量级的浓度，通过纳米lc通常使用2小时的梯度分离。这对质谱仪来说是一个巨大的挑战，因为质谱仪必须检测、分离和片段化尽可能多的肽。为了产生广泛的蛋白质鉴定信息，增加离子迁移率作为分离的额外维度，具有显着增加峰值容量的潜力。然而，这绝不能损害速度或灵敏度。

TIMS-PASEF^®
TIMS的独特设计使PASEF成为可能^®方法，其中浓缩的离子包从离子迁移池中洗脱，宽度为2-5 ms，使ms / ms采集速度> 100hz，占空比接近100%。因此，在速度和灵敏度增加的基础上获得了额外的分离，而TOF分析仪允许在所有MS和MS/MS速度下保持超高的MS/MS分辨率。

带PASEF的timsTOF Pro^®导致卓越的蛋白质鉴定性能和分析深度。当与nanoElute纳米流UHPLC和CaptiveSpray离子源相结合时，timsTOF Pro可以常规地从200 ng的HeLa细胞消化液中识别超过5000个蛋白质组，梯度为90分钟。

PASEF^®为了提高散弹枪蛋白质组学的通量
惊人的速度可用于减少梯度时间和提高吞吐量，同时保持前所未有的分析深度。从100 ng的Hela细胞消化液中，以30 min的梯度分离，可以鉴定出近4000个蛋白质组。

从TIMS分离中获得的显着灵敏度增加为低浓度样品提供了新的可能性。使用标准的PASEF^®12 ng的Hela细胞消化液以60分钟的梯度分离，鉴定出超过2900个蛋白质组。

理想的临床蛋白质组学伴侣
PASEF^®最终使临床蛋白质组学成为现实。该系统的速度和灵敏度的结合可重复地从50 ng注射中识别1400多个Hela细胞蛋白组，以5分钟的梯度分离。