SRX软件
与SRX定量分析软件
获取和本地化→
可视化→
分析
生物成像是一个定量的纪律
而图像本身可以视觉上给人印象深刻,提供定性、描述性信息、生物成像是更多关注定量测量。定量测量允许科学家们测试和研究假设并进行数据驱动实验。
本地化显微镜生成集的精确分子位置数据在一段时间内。雷竞技怎么下载然后使用该数据来创建图像。本地化数据可以直接定量分析样品中分子的位置,提供一个从根本上不同的类型的分析是可能的基于图像的技术,如发生和SIM卡。雷竞技怎么下载
类型的测量中可用的SRX软件
SRX软件提供了许多工具允许用户执行测量基于获取定位数据的统计分析。测量包括空间分布、聚类分析、co-localization分辨率分析、活细胞分析和生成控制数据的建模。
空间分布
实验检查定位数据的空间分布是基本面分析,并且可以额外的前体水平的分析。空间分布测量提供有价值的信息关于本地化的密度在不同区域的细胞。比较本地化细胞分布不同地区或不同地区位于相同的单元中提供可以提供有用的见解在治疗或条件的分子组成和提供推断价值理解通路和分子功能。雷竞技怎么下载提供分析工具包括雷普利的K分布,对相关性和最近的邻居。
聚类分析
分子经常形成集群,可以很容易地分辨通过空间分布分析。集群通常被认为或假设的潜在存在一个实验之前,基于研究结果与其他光学显微镜共焦等形式。
分子中存在集群的意义可能与他们的结构作用,其功能作用,或两者兼而有之。集群在某些情况下可能形成与条件的变化在一个细胞。也可能改变成分在不同条件下的集群。集群形成和成分也可能与其他集群或分子(见co-localization)。
集群的集群分析提供了更详细的分析观察样本。聚类分析对话框允许用户设置参数等聚类分析粒子类型、集群大小,和粒子数,并显示函数来帮助可视化集群形成,并查看各种测量参数和输出. csv或.mat文件。集群可视化也可以显示在主SRX可视化窗口,并且可以使用用于过滤数据。
聚类分析测量包括粒子计数、集群区域,集群密度、集群大小(体积),重心的位置,和PCA分析。
Co-localization
Co-localization是聚类分析和空间分析的自然延伸,并允许用户检查集群的关系的不同类型的分子以及分子的关系没有形成集群。
聚类分析对话框允许用户配置测量不同集群类型的分子。输出显示了图形显示的co-localization测量,表格数据,以及在SRX可视化窗口中显示图像结果。Co-localization . csv数据可以输出和.dat格式。
Co-localization测量包括曼德的重叠系数、强度相关性系数,对相关性,最近的邻居,联合直方图和Storm-RLA聚类分析。
Live-Cell分析
Live-cell实验经常需要量化粒子位置变化或集群(对象)。活细胞分析跟踪粒子位移随着时间的推移和展示他们的运动。
距离、速度和角分布直方图情节可以从这些数据生成协助分析。图形显示和运动块可以输出图像和表格数据可以输出. csv和.mat文件。
