蛋白定量

典型的挑战一道蛋白质定量的周期时间(定义色谱峰的分辨率),离子的独特性(s)选择确定一个肽数量(选择性)和系统灵敏度(low-abundance化合物的定量)。MS-based方法提供全面的定量结果但重叠离子减少这些工作流的选择性。基于MS / MS (DIA)定量提供了出色的选择性降低成本的敏感性。

TIMS-PASEF^®基于label-free定量(PASEF^®-LFQ)结合了这两种方法的最佳。蒂姆斯提供了一个额外维度的分离,极大地提高选择性,而蒂姆的预浓缩效应细胞提供了更大的敏感性。的PASEF^®周期时间是兼容狭窄nano-UHPLC山峰而速度(> 100 Hz MS / MS)大大提高了再现性的母离子选择相比,传统的基于块的方法。
在这种情况下,timsTOF专业独特的4 d-mbr方法允许克服的缺失值问题前所未有的敏感性。

在某些情况下,高度复杂的样品或短梯度分析,100 Hz MS / MS饱满率不足以可再生产地选择同一离子大量的分析

在这种情况下可再生的碰撞截面的决心(流动性)支持运行之间的4 d比赛(MBR)最大化的蛋白质量化标签免费量化实验,同时保持最高水平的信心高通量样品分析。4 d-mbr支持的方法是最新的山峰和MaxQuant版本。阅读我们的相应的LC-MS154应用注释。

步入未来:引入dia-PASEF^®
对于数据独立收购(DIA), dia-PASEF^®利用分子质量和流动性之间的关系目标地区最密集的肽。雷竞技怎么下载额外维度的结果增加选择性,增加灵敏度和更短的周期时间。更多信息关于dia-PASEF^®将限制4 d-proteomics™,读我们的LC-MS157应用注释。

MaxQuant数据处理
MaxQuant,流行,功能强大,完全支持PASEF开源软件^®-LFQ启用先进的定量数据,可视化和报告。

高级软件支持
现在越来越多的先进的蛋白质组学处理软件包直接读取timsTOF PRO原始数据:这包括天际线、基因数据,完整的蛋白质标准套件,吉祥物蒸馏器

峰值数据处理
山峰工作室是由高性能特征提取从蒂姆斯数据文件、获取高质量导致蛋白质肽链型识别,label-free定量和从头测序。多个复杂的可视化和出口能力允许用户评论,分享或从多个蛋白质组学分析提炼的结果。

Biognosys数据处理
Biognosys下一代蛋白质组学提供了一套完整的软件产品。Spectronaut软件旨在分析大规模data-independent收购和完全支持dia-PASEF蛋白质组学实验^®数据使用图书馆和library-free处理。PASEF^®数据处理是完全支持在Biognosys SpectroMine软件。

timsTOF Pro提供可持续的独特的能力表现在成千上万的注射结合增强LFQ性能使系统大规模临床研究的理想平台。

数据处理是关键蛋白质定量和PASEF^®-LFQ方法已经由一些最强大的软件套件。