鸟枪蛋白鉴定

复杂性问题
在典型的鸟枪蛋白质组学实验中，纳米lc通常使用2小时的梯度分离来自100多万种蛋白质形态的多肽，其浓度可达10个数量级。这对质谱仪来说是一个重大的挑战，因为质谱仪必须尽可能多地检测、分离和分解数百万个由此产生的多肽。为了产生广泛的蛋白质识别信息，添加离子迁移率作为额外的分离维度，有可能极大地提高峰值容量。但是，这绝不能损害速度或灵敏度。

TIMS-PASEF^®
TIMS的独特设计使PASEF^®浓缩离子包从离子迁移池中洗脱，宽度为2-5 ms，使ms / ms采集速度>100 Hz，占空比接近100%。在速度和灵敏度提高的基础上获得额外的分离，而TOF分析仪允许在所有MS和MS/MS速度下保持超高的MS/MS分辨率。

带PASEF的timsTOF Pro^®导致特殊的蛋白质鉴定性能和深度分析。当与nanoElute纳米流UHPLC和CaptiveSpray离子源结合时，timsTOF Pro可以常规地从200 ng的HeLa细胞摘要中识别出超过5000个蛋白质组，分离梯度为90分钟。

PASEF^®用于提高鸟枪蛋白质组学的产量
惊人的速度可用于减少梯度时间和提高吞吐量，同时保持前所未有的分析深度。用30分钟梯度分离的100 ng海拉细胞消化物可以鉴定出近4000个蛋白质组。

TIMS分离显著提高了灵敏度，为低浓度样品提供了新的可能性。使用标准PASEF^®方法，额外调整，12 ng海拉细胞文摘分离60分钟梯度鉴定超过2900个蛋白组。

临床蛋白质组学的理想伴侣
PASEF^®最终使临床蛋白质组学成为现实。该系统的速度和灵敏度相结合，从50 ng的注射中以5分钟的梯度分离，可重复识别超过1400个海拉细胞蛋白组。