4 d-proteomics™

随着timsTOF平台的引入，通过使用与UHR-QTOF技术耦合的TIMS，增加了气相离子分离的额外维度，从而实现了技术的下一次发展。这导致了从3d -蛋白质组学(保留时间，m/z和MS/MS指纹)到4d -蛋白质组学™(增加内在CCS值)的转变。

4D-MBR和dia-PASEF

4D-MBR和dia-PASEF^®: 4d -蛋白质组学™领域的引入

timsTOF Pro和timsTOF fleX中离子迁移率维度的增加带来了更多的好处，而不仅仅是灵敏度、选择性和MS/MS采集速度的提高。独特的时间设计可以重复测量所有检测到的离子的碰撞截面(CCS)值，这些可用于进一步提高系统的选择性，使复杂样品和短梯度分析的相对定量信息越来越可靠。

dia-PASEF®

4D-MBR:解决缺值问题

4D-MBR:解决短梯度LFQ实验的缺失值问题

DIA是解决价值缺失问题最广泛使用的采办策略。然而，使用它需要构建光谱库——当涉及到不常见的生物时，这可能是及时和困难的——而且传统的DIA方法太慢，无法与短梯度分析兼容。在这种情况下，PASEF-LFQ提供了速度、灵活性和可靠性。尽管如此，即使使用> 100Hz MS/MS，在每次分析中也可能不会选择一些肽进行片段化，特别是在使用短梯度时。

运行之间的匹配(Match Between Runs, MBR)方法已经开发出来解决这个缺少值的问题。MBR提取所有肽的强度信息，使用狭窄的m/z和保留时间窗口进行量化。这种过滤器的组合，之前被认为不够具体，导致不准确的比率测量。4D-MBR在第一个m/z和保留时间上增加了一个额外的CCS过滤器，允许更大的特异性，如我们的应用说明所示151年质．

4D-MBR应用于高通量血浆蛋白组学结果，用于192例患者和20例QC血浆样品的消化，使用Evosep One LC系统以11.5 min梯度分离。(按此放大)

dia-PASEF

dia-PASEF^®:将DIA分析提升到一个新的水平

DIA与PASEF的结合^®允许补偿传统的DIA缺陷:通过在连续的tims事件中使用m/z隔离窗口模式，DIA - pasef中使用的离子百分比雷竞技贴吧^®可以大大提高(对于低复杂度的样本高达100%，对于高复杂度的样本，仍然比使用类似隔离窗口大小和m:z范围的传统DIA方法高5倍)。的dia-PASEF^®循环时间可以减少，使其与短梯度分离兼容，同时保持高选择性。它受益于时间空间浓度效应，允许增加灵敏度，并将DIA选择性与完整的4D-Proteomics™支持提升到一个新的水平。

dia-PASEF^®数据可以使用越来越多的不同软件解决方案进行处理:这包括DIA-NN, Spectronaut, MaxQuant, Skyline, PEAKS。

通过阅读我们的申请说明了解更多信息120年质，157年质，160年质，167年质而且170年质．